Maanantai 24. kesäkuuta 2013. Australian ja Yhdysvaltojen tutkijat tarjoavat uutta tietoa genomin kolmiulotteisen rakenteen ymmärtämiselle, joka on yksi genomiikan ja genetiikan alan nykyisin suurimmista haasteista. Johtopäätökset se julkaisee digitaalisen versionsa. Luonnongenetiikka ".
Noin kolme metriä DNA: ta on taitettu tiiviisti kehomme jokaisen solun ytimeen, mikä antaa joidenkin geenien "ilmentyä" tai aktivoitua, toiset sulkematta pois. Lääkärit Tim Mercer ja John Mattick Sydneyn Garvanin lääketieteellisestä tutkimuksesta ja professori John Stamatoyannopoulos Washingtonin yliopistosta Seattlessa analysoivat genomin 3D-rakennetta korkealla resoluutiolla.
Geenit koostuvat "eksoneista" ja "introneista", joista ensimmäiset ovat sekvenssejä, jotka koodaavat ja ekspressoivat proteiineja, ja viimeiset, koodaamatonta DNA: ta ulottuvat väliaineeseen. Kun geenejä kopioidaan tai transkriptoidaan, RNA: n DNA: sta, intronisekvenssit leikataan tai "silmukoidaan" ja jäljelle jäävät eksonit ketjuutetaan yhdessä proteiinia koodaavan sekvenssin muodostamiseksi. Riippuen eksonista, jotka ovat vääntyneet, sama geeni voi tuottaa erilaisia proteiineja.
Käyttämällä suuria määriä ENCODE-projektin tietoja, tri Tim Mercer ja hänen kollegansa ovat päätellyt genomin laskostumisen havaittuaan, että jopa geenin sisällä valitut eksonit altistuvat helposti. "Kuvittele pitkä ja erittäin monimutkainen viiniköynnös, sen kiertyneet oksat, joista löytyy joitain rypäleitä, jotka voidaan helposti repiä pois, samalla kun ne piilottavat muita ulottumattomissaan", hän osoittaa esimerkin. Mercer.
"Samalla kuvittele laiska hedelmäkeräjä, joka poimii vain viinirypäleet sormenpäässäsi", hän lisää. "Sama periaate koskee genomia. Tietyt geenit ja jopa tietyt eksonit ovat taittamisen ulottuvilla." Tässä mielessä tämä tutkija huomauttaa, että tutkijat ovat viime vuosina alkaneet ymmärtää, kuinka genomin laskostuminen auttaa määrittämään sen ilmentymisen ja sääntelyn.
"Tämä tutkimus tarjoaa ensimmäisen osoituksen siitä, että genomin kolmiulotteinen rakenne voi vaikuttaa geenien silmukointiin. Voimme päätellä, että genomi taittuu siten, että promoottorialue, sekvenssi, joka aloittaa geenin transkription, on löytyy eksonien vierestä ja ne viedään kaikki kopiointikoneisiin ", hän painottaa.
"Tämä tukee uutta tapaa katsoa asioita, että genomi taipuu transkriptiolaitteiden ympärille eikä päinvastoin. Ne geenit, jotka ovat kosketuksissa transkriptiokoneiden kanssa, saavat kopioita, kun taas kaukana kiertävät osat niitä ei huomioida ", tutkija toteaa lopuksi.
Lähde:
Tunnisteet:
Sukupuoli Tarkista Uudistuminen
Noin kolme metriä DNA: ta on taitettu tiiviisti kehomme jokaisen solun ytimeen, mikä antaa joidenkin geenien "ilmentyä" tai aktivoitua, toiset sulkematta pois. Lääkärit Tim Mercer ja John Mattick Sydneyn Garvanin lääketieteellisestä tutkimuksesta ja professori John Stamatoyannopoulos Washingtonin yliopistosta Seattlessa analysoivat genomin 3D-rakennetta korkealla resoluutiolla.
Geenit koostuvat "eksoneista" ja "introneista", joista ensimmäiset ovat sekvenssejä, jotka koodaavat ja ekspressoivat proteiineja, ja viimeiset, koodaamatonta DNA: ta ulottuvat väliaineeseen. Kun geenejä kopioidaan tai transkriptoidaan, RNA: n DNA: sta, intronisekvenssit leikataan tai "silmukoidaan" ja jäljelle jäävät eksonit ketjuutetaan yhdessä proteiinia koodaavan sekvenssin muodostamiseksi. Riippuen eksonista, jotka ovat vääntyneet, sama geeni voi tuottaa erilaisia proteiineja.
Käyttämällä suuria määriä ENCODE-projektin tietoja, tri Tim Mercer ja hänen kollegansa ovat päätellyt genomin laskostumisen havaittuaan, että jopa geenin sisällä valitut eksonit altistuvat helposti. "Kuvittele pitkä ja erittäin monimutkainen viiniköynnös, sen kiertyneet oksat, joista löytyy joitain rypäleitä, jotka voidaan helposti repiä pois, samalla kun ne piilottavat muita ulottumattomissaan", hän osoittaa esimerkin. Mercer.
"Samalla kuvittele laiska hedelmäkeräjä, joka poimii vain viinirypäleet sormenpäässäsi", hän lisää. "Sama periaate koskee genomia. Tietyt geenit ja jopa tietyt eksonit ovat taittamisen ulottuvilla." Tässä mielessä tämä tutkija huomauttaa, että tutkijat ovat viime vuosina alkaneet ymmärtää, kuinka genomin laskostuminen auttaa määrittämään sen ilmentymisen ja sääntelyn.
"Tämä tutkimus tarjoaa ensimmäisen osoituksen siitä, että genomin kolmiulotteinen rakenne voi vaikuttaa geenien silmukointiin. Voimme päätellä, että genomi taittuu siten, että promoottorialue, sekvenssi, joka aloittaa geenin transkription, on löytyy eksonien vierestä ja ne viedään kaikki kopiointikoneisiin ", hän painottaa.
"Tämä tukee uutta tapaa katsoa asioita, että genomi taipuu transkriptiolaitteiden ympärille eikä päinvastoin. Ne geenit, jotka ovat kosketuksissa transkriptiokoneiden kanssa, saavat kopioita, kun taas kaukana kiertävät osat niitä ei huomioida ", tutkija toteaa lopuksi.
Lähde: